从营养价值来说，两者差异不是很大，都是钙的来源，也是蛋白质、维生素AD和维生素B族的好来源。
从保健效果来说，酸奶更好。它有调节免疫、预防肠道感染疾病、改善胃肠功能的作用，是世界公认的健康食品。
酸奶有利于人类健康和长寿的原因可能有：
1、酸奶可增强人体免疫功能；
2、降低血清胆固醇的水平。有实验证明，甚至在不用任何的情况下。每餐饮用约24O克酸奶，一周后可见胆固醇降低。
3、常饮用酸奶能促进肠道运动，缩短食物口一肛转运时间，软化酵解结肠内容物，增加粪便排泄量，预防发生，有益干预防结肠癌。因此，酸奶在国外被誉为长寿食品。
从饱腹感来说，两者都很好。轻微饥饿时喝一杯牛奶或酸奶可以有效缓解迫切的食欲，可减少下一餐的进餐量。但饭后喝都没有效果。
从中医角度说，牛奶可能让某些人上火；还有很多人喝牛奶肚子不舒服，然而酸奶适合于所有人，也不会上火。只要酸奶不太凉，就可以一年四季饮用。