绿色食品标准是指“应用科学技术原理、结合绿色食品生产实践、借鉴国内外相关标准所制定的，在绿色食品生产中必须遵守、绿色食品产品质量认证时必须依据的技术性文件。”
绿色食品标准体系是对绿色食品产销实行全程质量控制的一系列标准的总和和系统，包括四个方面：绿色食品产地环境质量标准；绿色食品生产技术标准；绿色食品产品标准；绿色食品包装、标签、储运标准。
绿色食品标准体系有如下鲜明特点：
1.内容的系统性。绿色食品标准体系贯穿生产的产前、产中、产后全过程，涉及产地环境、生产过程、产品质量、包装标签、贮藏运输等诸多环节。
2.制订的科学性。从1990年起，农业部正式提出开发绿色食品时，绿色食品发展中心先后组织国内各方面的专家，经过上千次试验、检测和参照或采纳标准以及国外先进标准而制定的，对严于现在执行标准的项目及其指标值都有文献性的科学依据或理论指导。
3.指标的严格性。绿色食品的标准无论从产品的感观性状、理化性状、生物性状都严于或等同于现行的国家标准。例如大气环境质量采用国家一级标准，农残限量仅为有关国家和标准的1/2。
4.控制项目的多样性。绿色食品产地环境质量标准中土壤标准比国家标准增加了土壤肥力指标；产品标准增加了营养质量指标等项目。产地环境质量评价中，对水质、土壤、空气等要素分别区分了污染严控指标和一般控制指标若干项。增加控制项目的目的在于防止有害物质对产品的污染，绿色食品的质量。